临床科室设置如下科室：
妇科门诊主要开展对妇科常见病、多发病的诊治；开展阴道炎、盆腔炎、月经不调、筛查早期宫颈癌的三阶梯技术等；开展计划生育手术，放环、药物流产、人工流产、无痛引流产；通过阴道镜检查和宫颈液基细胞学检查，可以诊断宫颈病变、筛查早期宫颈癌。
产科门诊设有普通门诊，高危门诊、优生咨询门诊。普通门诊负责早孕及孕早期有关疾病的诊断和治疗，初步筛查高危孕妇，提供孕前准备，优生优育基本知识，孕期注意事项，孕期合理用药的优生咨询，开展胎心监护、产前保健检查，妇科检查等；高危门诊由经验丰富的医师对高危孕妇采取专案管理，给予系统化建档立卡，定期检查，按时电话追踪，提高孕妇的安全保健意识，确保母婴安康。
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